< Modélisation

Berapa banyak orang yang menularkan COVID di sekitar saya?

Teks diperbarui 2020-11-19


Apa risiko bertemu orang yang menular di jalan atau dalam pertemuan? Berikut adalah perhitungan berdasarkan jumlah entri resusitasi yang memperkirakan jumlah orang menular di sekitar Anda.

Di jalan, dalam pertemuan, di kelas, atau di toko, Anda mungkin pernah bertanya-tanya berapa banyak orang COVID menular di sekitar Anda. Sayangnya, Anda tidak bisa mengatakan dengan mengamati orang karena banyak orang yang menular tidak memiliki gejala. Selain itu, jumlah ini bervariasi dari hari ke hari dan menurut wilayah. 

Mengapa perkiraan berdasarkan tingkat kejadian tidak memuaskan?
Perkiraan sederhana tentang risiko menghadapi orang yang menular menggunakan tingkat insiden. Menurut definisi, tingkat ini adalah proporsi orang positif baru dalam populasi pada waktu tertentu. Lihat pertanyaan Apa risiko bertemu orang COVID dalam kelompok, mengetahui tingkat kejadian?. Namun, tingkat ini, yang sering dipublikasikan di situs web resmi, diperkirakan dari jumlah tes positif, yang tergantung langsung pada jumlah orang yang diuji. Oleh karena itu sangat sensitif terhadap kondisi yang menyebabkan orang diuji atau tidak. Misalnya, di Prancis pada bulan Maret dan April 2020, sangat sedikit orang yang diuji, dan kurva insiden meningkat sangat sedikit sementara jumlah orang yang dirawat di rumah sakit meningkat secara signifikan. Di Prancis, penyaringan meningkat secara signifikan dari awal Agustus hingga akhir Oktober 2020, dan tingkat insiden serupa. Pada minggu pertama November 2020, kedua tarif turun secara bersamaan(data SI-DEP). Akhirnya, setiap kali pusat pengujian baru dibuka di kota, tingkat insiden meningkat.

Kami memutuskan untuk memperkirakan jumlah orang yang menular berdasarkan jumlah entri resusitasi, yang tidak tergantung pada kebijakan pengujian. Dengan mengikuti alasan kami, Anda akan dapat membiasakan diri dengan perkiraan epidemiologis dan memahami mengapa setiap perkiraan memiliki keterbatasan. 

Apa yang diberikan estimator kita?
Kami memperkirakan bahwa pada awal November 2020, di Toulouse kami bertemu 2 orang yang terinfeksi yang lewat dari seribu, dan 5 di Lyon. Seribu orang: ini sesuai dengan jumlah orang yang lewat dalam satu jam di jalan yang sibuk, penumpang di kereta bawah tanah penuh, atau siswa dari perguruan tinggi besar. Probabilitas bahwa, dalam kelompok setidaknya 25 orang, setidaknya satu terinfeksi, adalah 5% di Toulouse, dan 12% di Lyon. Hati-hati, perkiraan kami tidak sempurna: ini adalah urutan besarnya (lihat "batas" paragraf di bagian bawah halaman). Untuk melihat perkiraan hari ini, klik untuk membuka tabel yang menunjukkan jumlah orang menular di Paris, Marseille, Lyon dan Toulouse, di jalan dan dalam pertemuan. Tabel ini diperbarui setiap hari. Meja lain, juga berdasarkan pintu masuk ke Rea, memberikan setiap hari jumlah orang yang terinfeksi pada 1000 orang yang lewat di jalan untuk 30 departemen: Tiga puluh kota di Prancis, diklasifikasikan oleh kepadatan penularan

Bagaimana kita dapat memperkirakan jumlah COVID-19 ?
Membuat perkiraan sedikit seperti membuat kue: untuk menjadi baik, Anda membutuhkan bahan-bahan yang baik dan resep yang baik. Bahan-bahan di sini adalah data dan parameter model. Data berubah setiap hari dan berdasarkan wilayah, dan perlu diperbarui. Parameter terkait dengan virus dan penyakit: mereka ditemukan dalam artikel ilmiah dan mereka tidak banyak berubah. Resepnya adalah cara menggabungkan data ini dan parameter ini, berdasarkan rumus matematika, ke dalam spreadsheet (spreadsheet) yang secara langsung menampilkan hasil yang diharapkan. Ini adalah kue yang kita bagikan secara online.

Berikut sudah daftar bahan: data dan parameter

Berikut adalah resep untuk menggabungkan bahan-bahan ini: langkah-langkah perhitungan

Bagi mereka yang lebih suka persamaan, lihat Kalkulator di bawah ini, dan teks di sebelah kanan hasil pada Coronavirus Carriers di Paris, Lyon, Marseille, Toulouse dan Prancis.

Lakukan matematika untuk kota atau negara Anda!
Anda dapat memperkirakan sendiri jumlah orang yang terinfeksi di kota, wilayah, atau negara Anda hari ini, jika Anda telah memiliki data rea selama dua minggu. Cukup masukkan mereka, serta ukuran populasi, di Kalkulator di bawah ini (data untuk Prancis: Réa-GéoDES; untuk negara lain: OurWorldInData). Ini adalah waktu yang cukup lama untuk bekerja, karena Anda harus mencatat entri dalam Rea lebih dari 15 hari dalam tabel interaktif ini, untuk menghitung regresi. Dan jangan lupa untuk menempatkan ukuran populasi! Kalkulator ini juga memungkinkan Anda untuk mengubah nilai pengaturan, jika Anda ingin menguji bagaimana hal ini mengubah hasilnya. Klik untuk melihat KalKULATOR Covid ini (baca saja. Untuk menggunakannya, salin atau unduh).

Apa batas estimator ini?
Estimator ini bukan model canggih seperti para ahli epidemiologi yang menyarankan pemerintah dengan memproyeksikan evolusi epidemi selama beberapa minggu: itu hanya menjawab pertanyaan sederhana, untuk hari perhitungan. Berikut adalah beberapa keterbatasannya.

Perhitungan ini juga menyajikan keterbatasan terperinci dalam pertanyaan Apa risiko melintasi orang COVID dalam kelompok, mengetahui tingkat kejadian?.

 Kesimpulannya, perhitungan yang disajikan di sini memberi kita gagasan kasar tentang jumlah orang yang menular di sekitar kita. Angka ini tidak boleh diambil sebagai nilai yang tepat, melainkan sebagai urutan besarnya. Versi asli dari model ini disajikan di situs web penulisnya, Florence - Denis Corpet: Berapa banyak penularan di kota saya?


Facebook Twitter Linkedin

Sumber

Sebuah studi kohort multi-center rumah sakit di Prancis, Belgia dan Swiss diikuti lebih dari 4.000 pasien yang dirawat di unit perawatan intensif antara akhir Februari dan awal Mei 2020. Kematian (diperkirakan 90 hari) pasien Réa menurun terus dari 42 menjadi 25% selama periode ini (Tabel S5), dengan kasus rata-rata antara 31% dan periode yang sama. Waktu rata-rata antara gejala pertama dan rea adalah delapan hari dalam penelitian ini, untuk pasien yang akhirnya meninggal karena COVID-19 (Tabel 1, baris 13, coL4).

Covid-ICU, untuk jaringan REVA dan penyelidik COVID-ICU. (2020) Karakteristik Klinis dan Hasil Hari-90 dari 4.244 orang dewasa yang sakit kritis dengan COVID-19 studi calon kohort. Obat Perawatan Intensif DOI: 10.1007/s00134-020-06294-x

Studi italia berskala besar ini menilai faktor risiko kematian pasien di unit perawatan intensif di Lombardy. Kami menggunakannya terutama untuk mengetahui bahwa ada tujuh hari antara gejala pertama seseorang yang akan meninggal dunia De Covid-19 dan masuk ke resusitasi (Tabel 3, baris 16, col.3, artikel).

Grasselli, G., Greco, M., Zanella, A., Albano, G., Antonelli, M., Bellani, G., ... - Cattaneo, S. (2020). Faktor risiko yang terkait dengan kematian di antara pasien dengan COVID-19 di unit perawatan intensif di Lombardy, Italia. JAMA penyakit dalam, 180(10), 1345-1355.

Dalam tinjauan dan meta-analisis 24 studi observasional, penulis Inggris melacak nasib pasien resusitasi (unit perawatan intensif) di Asia, Eropa dan Amerika Utara. Kami menggunakan persentase kematian pasien dalam layanan resusitasi Eropa, 48,44% dari tujuh studi (Gbr.3 dari artikel), sementara secara global adalah 41,65%.

Armstrong, R. A., Kane, A.D., Cook, T.M. (2020). Hasil dari perawatan intensif pada pasien dengan COVID-19: tinjauan sistematis dan meta-analisis studi observasional. Anestesi, 75(10), 1340-1349.

Thomas PUEYO menerbitkan artikel tentang "Medium" pada 12 Maret 2020, yang telah dilihat sebanyak 26 juta kali. Dengan model sederhana, itu menunjukkan bahwa bencana sudah dekat. Pada pertengahan Maret, ia menyerukan kepada para kepala negara dan pemimpin bisnis untuk bertindak sangat cepat untuk membatasi penularan. Pertumbuhan eksponensial dalam jumlah pasien adalah ancaman serius bagi dunia. Persamaan modelnya klasik, hampir tidak dipertanyakan, dan tersedia dalam bagan online. Kami menggunakan ide-ide dasarnya dan yang paling sederhana dari persamaannya, tetapi tidak mengambil model epideminya, yang tidak lagi kami terapkan hari ini. T. Pueyo adalah seorang insinyur, artikelnya yang dia sendiri tanda tangani tidak diterbitkan dalam jurnal ilmiah.

https://medium.com/tomas-pueyo/coronavirus-agissez-aujourdhui-2bd1dc7838f6

Artikel Salje dkk menggambarkan keadaan epidemi di Prancis selama gelombang pertama, dan mengusulkan kasus antara orang yang terinfeksi sebesar 0,5% yang telah kami pertahankan dalam perhitungan kami (dengan koreksi 26 Juni 2020, yang diterbitkan di situs web Sains).

Salje, H., Kiem, C. T., Lefrancq, N., Courtejoie, N., Bosetti, P., Paireau, J., ... - Le Strat, Y. (2020). Memperkirakan beban SARS-CoV-2 di Prancis. Ilmu.

Levin dkk menunjukkan dalam meta-analisis mereka bahwa tingkat hukum kasus sangat tergantung pada usia pasien, sehingga akan berbeda pada populasi yang lebih tua (misalnya Eropa) dan populasi muda (afrika misalnya). Itulah sebabnya kalkulator interaktif yang kami tawarkan memungkinkan Anda untuk mengubah semua parameter, termasuk tingkat kasus.

Levin, A. T., Hanage, W. P., Owusu-Boaitey, N., Cochran, K.B., Walsh, S. P., Meyerowitz-Katz, G. (2020). Menilai Kekhususan Usia Tingkat Fatalitas Infeksi untuk COVID-19 Dalam: Tinjauan Sistematis. Meta-Analisis, dan Implikasi Kebijakan Publik. medRxiv, 2020 (2023.20160895).

Jurnal online Coronavirus Fact-Checking Taskforce (https://zici.fr/49) membahas durasi penularan dalam paragraf "Periode infeksi: berapa durasinya?". Ini, menurut definisi, jumlah hari ketika penularan lebih dari 50% dari maksimumnya. Dengan demikian didefinisikan, itu berlangsung sembilan hari. Di antara penelitian untuk memajukan angka ini, bahwa Hulfel dkk menunjukkan bahwa RNA virus dari sampel nasofaring tidak dapat lagi menginfeksi sel dalam budaya setelah 8 hari.

Welfel, R., Corman, V.M., Guggemos, W., Seilmaier, M., Zange, S., Muller, M. A., ... - Hoelscher, M. (2020). Penilaian virologis pasien rawat inap dengan COVID-2019. Alam Welfel, 581(7809), 465-469.

Dalam komune Italia Vo' (3400 penduduk), hampir seluruh populasi diuji oleh PCR dua kali, pada akhir Februari dan awal Maret 2020, untuk mengetahui membawa virus corona. 42,5% dari mereka yang terinfeksi virus adalah pembawa asimptomatik.

Lavezzo, E., Franchin, E., Ciavarella, C., Cuomo-Dannenburg, G., Barzon, L., Del Vecchio, C., ... - Abate, D. (2020). Penindasan terhadap wabah SARS-CoV-2 di kotamadya Vo'. Alam, 584 (7821), 425-429.

Di Inggris, hasil survei besar yang dilakukan pada Juni 2020 pada 36.000 orang non-rumah sakit menunjukkan bahwa 115 memiliki tes PCR positif pada hari sampel, dan bahwa 88 orang yang dites positif tidak bergematik hari itu, atau 76,5%. Jika seseorang melihat secara khusus gejala spesifik Covid-19 , persentase ini naik menjadi 86% pada hari tes.

Petersen, I., Phillips, A. (2020). Tiga Perempat Orang dengan Infeksi SARS-CoV-2 adalah Asimptomatik: Analisis Data Survei Rumah Tangga Inggris. Epidemiologi Klinis, 12, 1039.

Untuk informasi selanjutnya

Apa risiko bertemu orang COVID dalam kelompok, mengetahui tingkat kejadian?

Mengapa pertemuan tidak direkomendasikan selama epidemi COVID-19 ?

Letalitas, mortalitas, R0, kappa: apa artinya?

Berapa lama seseorang bisa menular?

Mengapa situasi "super-propagating" sangat penting dalam memahami epidemi COVID-19 ?

Bisakah kita memprediksi evolusi epidemi COVID-19 ?

Apa risiko meninggal dunia COVID-19 untuk orang yang terinfeksi?

Perawatan pasien dengan COVID-19 Apakah sudah membaik?

Berapa jarak yang disarankan antara dua orang?