< Variants
Apa saja yang berbeda coronavirus SARS-CoV-2 yang menarik perhatian?
Teks terakhir diperbarui pada 2021-06-23
Varian VoC 202012/01, juga disebut B1.1.7 atau varian Inggris atau varian Alpha: lihat pertanyaan Apa yang kita ketahui tentang varian Inggris?.
Mutasi D614G yang menyebabkan garis keturunan B.1
D614G adalah mutasi SARS-CoV-2 yang paling lazim di Eropa (kecuali Islandia). Mutasi ini mempengaruhi protein Spike dan tampaknya meningkatkan afinitas protein Spike ke reseptor ACE2. Varian ini berbeda dengan urutan asli virus corona yang teridentifikasi di Wuhan, China pada Desember 2019. Tampaknya muncul di Cina dan kemudian menyebar ke Italia pada Januari 2020 dan di seluruh Eropa, Amerika Serikat, Kanada dan Australia. Pada Januari 2021, varian ini menjadi bentuk dominan virus corona, bentuk pandemi. Mutasi yang dijelaskan pada April 2020 ini telah menyebabkan banyak tinta di pers tentang efek potensialnya dalam meningkatkan transmisi varian dibandingkan dengan bentuk aslinya. Sampai saat ini, penyebab Penyebaran varian ini, yang mungkin merupakan campuran kesempatan dan seleksi alam.
Varian Cluster 5
Varian ini terdeteksi pada November 2020 di Denmark. Ini mengandung 4 mutasi yang mempengaruhi protein Spike, termasuk mutasi Y453F dan 69-70del. Varian ini diidentifikasi pada cerpelai yang kemudian menginfeksi manusia yang bekerja di peternakan cerpelai. Penemuan varian ini telah menyebabkan eutanasia semua cerpelai Denmark karena khawatir varian ini akan membuat vaksin dalam pengembangan tidak efektif dan untuk mencegah cerpelai menjadi reservoir potensial varian.
Varian 501v2 atau B.1.351 atau Beta
Varian ini diperkirakan muncul pada Agustus 2020, di Afrika Selatan di tenggara negara itu sebelum menyebar ke Cape Town, ke arah barat dan utara menuju Durban. Varian ini memiliki 8 mutasi yang mempengaruhi protein Spike, termasuk E484K, K417N dan N501Y yang berada di titik-titik penting protein. Mutasi ini dapat meningkatkan penularan dan mengurangi respons kekebalan tubuh yang diinduksi oleh vaksin.
Varian P.1 atau B.1.1.248 atau Gamma
Varian ini pertama kali dijelaskan di Brasil pada Desember 2020. Ini memiliki 10 mutasi pada protein Spike, termasuk mutasi N501Y dan E484K.
Varian B.1.617.2 atau Delta, dan B.1.617.1 atau Kappa
Varian ini pertama kali dijelaskan di India pada Oktober 2020. Mereka mengandung beberapa mutasi pada protein Spike, termasuk mutasi L452R dan E484Q.
Cara membatasi Penyebaran varian yang lebih mudah dikomunikasikan?
Untuk memperlambat Penyebaran COVID-19 dan untuk membatasi penularan varian yang bisa lebih menular, sangat penting bagi semua orang untuk sangat waspada. Anda harus memakai masker disaring dengan baik dan pas di wajah (lihat pertanyaan Mengapa menempatkan masker ? dan pertanyaannya masker bedah atau masker kain: mana yang harus dipilih?). Penting untuk menghormati jarak aman, mencuci tangan secara teratur, ventilasi tempat sesering mungkin dengan udara luar dan tentu saja menghindari kerumunan.
Sumber
Penelitian ini melacak Penyebaran varian yang merupakan asal usul garis keturunan B.1 dengan mutasi D614G yang mengubah protein Spike. Mutasi ini awalnya terdeteksi di China dan Jerman pada akhir Januari 2020. Pada Bulan Maret 2020, bentuk bermutasi (varian B.1) dan bentuk unmutated hadir di Eropa. Pada April 2020, varian B.1 telah menjadi dominan di Eropa dan hadir dalam 78% genom SARS-CoV-2 berurutan. Kemunculan varian ini terjadi secara tidak sinkron di berbagai belahan dunia mulai di Eropa (kecuali Islandia), kemudian di Amerika Utara, Oseania dan akhirnya di Asia. Studi terhadap 999 pasien (termasuk 756 operator varian) di Britania Raya menunjukkan bahwa varian tersebut dikaitkan dengan beban virus yang lebih tinggi tetapi tidak berpengaruh pada tingkat keparahan COVID-19 . Untuk memeriksa apakah varian ini lebih dapat ditransmisikan, penulis menciptakan pseudovirus dengan protein Spike dengan atau tanpa mutasi D614G. Mereka menunjukkan bahwa pseudovirus yang mengandung mutasi dikaitkan dengan infeksi yang lebih besar.
Korber, B., Fischer, W.M., Gnanakaran, S., Yoon, H., Theiler, J., Abfalterer, W., ... - Montefiori, D.C. (2020). Melacak perubahan dalam Lonjakan SARS-CoV-2: bukti bahwa D614G meningkatkan infektivitas COVID-19 Virus. Sel, 182(4), 812-827.Studi tentang Penyebaran dan prevalensi di Inggris dari varian SARS-CoV-2 dengan mutasi D614G pada lebih dari 25.000 genom berurutan. Hasilnya tidak mengarah pada kesimpulan tentang mekanisme yang bertanggung jawab atas Penyebaran varian: keunggulan selektif atau efek peluang. Para peneliti tidak menemukan perbedaan klinis dalam tingkat keparahan penyakit atau tingkat kematian antara orang yang terinfeksi dengan salah satu bentuk virus corona. Varian D614G dikaitkan dengan viral load yang lebih tinggi dan usia pasien yang lebih rendah daripada bentuk unmutated.
Volz, E., Hill, V., McCrone, J. T., Price, A., Jorgensen, D., O'Toole, 2020. Mengevaluasi efek mutasi Lonjakan SARS-CoV-2 D614G pada transmissibilitas dan patogenitas. Sel.HAMster yang terinfeksi SARS-CoV-2 dengan mutasi D614G menghasilkan judul infeksi yang lebih tinggi di pencucian hidung dan trakea, tetapi tidak di paru-paru, menguatkan bukti klinis bahwa mutasi meningkatkan beban virus di saluran pernapasan atas pasien dengan COVID-19 dan dapat meningkatkan jumlah penularan .
Plante, J. A., Liu, Y., Liu, J., Xia, H., Johnson, B. A., Lokugamage, K. G., ... -Shi, P. Y. (2020). Mutasi lonjakan D614G mengubah kebugaran SARS-CoV-2. Alam, 1-6.Prevalensi keseluruhan D614G dikaitkan dengan prevalensi hilangnya bau (anosmia) sebagai gejala COVID-19 .
Butowt, R., Bilinska, K., Von Bartheld, C.S. (2020). Disfungsi kemosensori di COVID-19 : Integrasi data genetik dan epidemiologi menunjuk ke varian protein D614G Spike sebagai faktor penyumbang. Ilmu saraf kimia ACS, 11(20), 3180-3184.Analisis awal menunjukkan bahwa varian SARS-CoV-2 yang diisolasi dari cerpelai di Denmark, varian Cluster 5, mungkin kurang mudah dinetralisir oleh antibodi yang diproduksi oleh pasien yang sebelumnya terinfeksi coronavirus SARS-CoV-2 tanpa mutasi ini. Memang, dua dari mutasi Cluster 5 (69-70del dan Y453F) yang terletak pada protein Spike dapat membuatnya lebih sulit untuk menempelkan antibodi ke virus corona dan memungkinkan virus corona untuk melarikan diri dari sistem kekebalan tubuh. Efeknya kecil dan diamati pada angka kecil. Tetapi telah memicu kekhawatiran luas di media, menunjukkan bahwa vaksin dalam pengembangan dapat kehilangan efektivitas dengan varian ini.
Lassaunière R, Fonager J, Rasmussen M et al. (2020) MUtasi Lonjakan SARS-CoV-2 yang timbul pada cerpelai Denmark dan penyebarannya ke manusiaPenelitian ini menjelaskan varian 501Y. V2 terdeteksi di Afrika Selatan dan diurutkan pada 14 Desember 2020. Analisis data yang diperoleh dalam pengawasan rutin hingga 14 Desember 2020 (jumlah pasien, jumlah kematian, dll.) dan 2589 genom SARS-CoV-2 yang dikumpulkan antara 5 Maret dan 25 November 2020. Analisis menunjukkan bahwa varian muncul pada Agustus 2020 dan kemudian menyebar. Antara 15 Oktober dan 25 November, 190 urutan berisi varian 501Y. V2 telah terdeteksi karena varian ini telah menjadi garis keturunan yang paling umum di provinsi tanjung timur dan barat.
Tegally, H., Wilkinson, E., Giovanetti, M., Iranzadeh, A., Fonseca, V., Giandhari, J., ... - de Oliveira, T. (2020). Munculnya dan penyebaran cepat garis keturunan coronavirus 2 (SARS-CoV-2) terkait sindrom pernapasan akut baru dengan beberapa mutasi Lonjakan di Afrika Selatan. medRxiv( medRxiv).Daftar varian SARS-CoV-2
SIAPA